La pulsación en la música de Juan Trigos, es el motor esencial de su concepción musical. De ésta emergen diversos procesos y códigos de lectura que manipulan materiales originales o tomados de otras fuentes.
La idea “Concertante” predomina en el tratamiento y en la relación entre el solo(s) y las diversas combinaciones instrumentales.
Las duraciones, las alturas y la forma en general, están organizadas con rigor y manejadas de modo abstracto. El material es siempre susceptible a la innovación, no solo en el sentido de la especulación pura, sino también como la asimilación de la propia experiencia musical.

Como director se a especializado en música del siglo XX y particularmente en música contemporánea. Ha estrenado un sinnúmero de partituras de compositores de todo el mundo. Ha dirigido algunas de las principales orquestas, coros y ensambles del país, así como de EUA y Europa.

Algunas de sus composiciones mas representativas son la “Danza Concertante Nº 1” para piccolo y orquesta, las “Pulsatas”, los “Ricercares de Cámara”, el “Magnificat Guadalupano”, cantata concertante para solos, coro y orquesta, los “Concertini” y su “Missa Cunctipotens Genitor Deus”, para barítono solo, coro mixto, dos pianos “concertantes” y percusiones.

Es el creador del género “Ópera de Hemoficción”.
Su Ópera “DeCachetitoRaspado” versión (2002) de cámara en 1 acto, se representó en abril de 2003 en la Biennale Zagreb, en noviembre de 2003 en el XXXI Festival Internacional Cervantino y en noviembre de 2003 en el XXV Foro Internacional de Música Nueva “Manuel Enríquez”, con la participación del Ensamble Icarus-Cantus, bajo la dirección del autor.

“DeCachetitoRaspado” versión (2004) en dos actos para 4 cantantes, 4 actores, ensamble en escena (8 músicos), coros y orquesta sinfónica, se grabó en el mes de septiembre de 2004 en San Petersburgo (Rusia), con la participación de los cantantes: Claudia Montiel, Gabriela Thierry, Benito Navarro y José Guadaluoe Reyes. Los actores: Berta Vega, Itzia Zerón, Guillermo Jair y Lorenzo Mijares. El “Academic Choir Saint Petersburg-Concert” y la “State Symphony Orchestra of Saint-Petersburg”, bajo la dirección del compositor.